螺桿式冷水機組的正確調試是保證制冷裝置正常運行、節省能耗、延長使用壽命的重要環節。對于現場安裝的大、中型制冷系統，調試前首先應按設計圖紙要求，熟悉整個系統的布置和連接，了解各個設備的外形結構和部件性能，以及電控系統和供水系統等。為此，調試時應有制冷和水電等工程師參加。用戶在調試前應認真閱讀廠方提供的產品操作說明書，按操作要求逐步進行。操作人員必須經過廠方的專門培訓，獲得機組的書才能上崗操作，以免錯誤操作給機組帶來致命的損壞。

在充注制冷劑前，應預先備有足夠的制冷劑。充注時，可直接從充液閥門充入。由于系統處于真空狀態，鋼瓶中制冷劑與系統壓差較大，當打開閥門時（應先用制冷劑吹出連接管中的空氣，以免空氣進入機組，影響機組性能），制冷劑迅速由鋼瓶流入系統，充注完畢后，應先將充液閥門關閉，再移去連接管。

制冷系統調試。制冷劑充注結束后（如需要充注制冷劑），可以進行負荷調試。由于近年來，螺桿式冷水機組在性能和電氣控制方面都有了長足的進步，許多螺桿式冷水機組在正式開機前可以對主要電控系統做模擬動作檢測，即機組主機不通電，控制系統通電，然后通過機組內部設定，對機組的電控系統進行檢測，組件是否運行正常。如果電控系統出現什么問題，可以及時解決。再通上主機電源，進行調試。

螺桿式冷水機組的清洗過程如下：先將清洗劑注入液槽中，然后啟動泵，使之運轉，開始清洗。清洗時按正向、反向進行多次操作，直到清洗劑不顯酸性為止。對于輕度的污染，只要循環1小時左右即可。而嚴重污染的，則需要3－4小時。若長時間清洗，清洗劑已臟，過濾器也有堵塞臟污，應更換清洗劑和干燥過濾器以后再進行此操作。系統清洗洗凈后，清洗劑已臟，過濾器也有堵塞臟污，在儲液器中的清洗劑要從液管回收。清洗完畢，應對制冷管路進行氮氣吹污和干燥處理，保證冷水機組正常運行。